Utsläpp av syreförbrukande ämnen och närsalter (fosfor och kväve) bidrar till övergödning av vatten vid massafabriker, sågverk och timmerterminaler. För Södra är massafabrikernas utsläpp av närsalter klart dominerande och har sitt ursprung i veden, i inkommande vatten samt i tillsatskemikalier. Studier har visat att runt 30 % av fosforn och mindre än 10 % av kvävet som kommer in till en massafabrik lämnar densamma via avloppet.

Vid Södra Cells massafabriker i Sverige finns biologiska reningsanläggningar. Reningsanläggningarna har trimmats in för att så långt möjligt minska utsläppen av syreförbrukande ämnen och närsalter. Här bryts även tillsatskemikalier, som komplexbildare, ner.

De totala utsläppen av kväve och fosfor har sedan 1995 minskat med 15 respektive 30 %. Relaterat till virkesanvändningen har utsläppen sänkt med 61 % för kväve och 69 % för fosfor.